Признание банкротом решением Арбитражного суда РД «Махачкалинского ПАТП-2» создало ряд проблем для жителей Махачкалы Дагестана, в связи с дестабилизацией работы городского автотранспорта (газомоторных автобусов), курсирующего по маршруту «Ватан – путепровод пр. Петра I» и «Махачкала – Каспийск».
В 2019 году из-за больших долгов Арбитражный суд Дагестана признал предприятие банкротом. 28 мая 2020 года руководство Министерства транспорта Дагестана получило уведомление по приостановлению деятельности «Махачкалинского ПАТП-2» в связи с убыточностью и сокращением сотрудников предприятия, а затем начато конкурсное производство.
Минтранс РД на сегодняшний день ищет возможность помочь обанкротившемуся предприятию и решить проблему пассажироперевозок в городе Махачкала.